在西历2146年，这里有一个平静的小岛，故事的主人公和他的朋友一起居住在这里，有一天这里突然响起了奇怪的声音，来自未知的生命体开始发起的侵略，后来主人公他们得知在29年前由于这些未知生命体的侵略，整个日本已经不复存在，这个小岛其实是他们为了救赎人类而建造的人工岛，居住在这个岛上的人曾经都是经受过特殊训练的某一组织的成员，当他们得知自己以生存的和平年代受到了这样毁灭性的打击后他们被卷入了人类和未知生命体的生死存亡之战中，这些少年少女们为了保护岛上的人群开始勇敢的加入战斗，人类为了防御未知生命体他们开发了一种兵器，而驾驶这个兵器的孩子从出生的时候就被注入了特殊的因子，在与未知生命体斗争的过程中他体内的染色体就会变成接近于未知生命体的形态，而他自己也会慢慢地走向死亡…
